El Matabot té pensat desaparèixer més enllà del Confí Corporatiu. En el trajecte, però, descobreix que pot ajudar al cas de la Dra. Mensah contra la corporació de GrayCris si aconsegueix proves d’activitats il·legals al planeta Milu. Allà es trobarà amb un nou grup d’humans a qui no li quedarà més remei que protegir, i comptarà amb l’ajuda del Miki, el bot humanoide que els acompanya.
Protocol rebel és el tercer volum d’El diari del Matabot, que va guanyar el premi Hugo a millor sèrie.
